Tak, jak we wszystkich przeprowadzanych zabiegach leczniczych, również w przypadku rehabilitacji w formie masaży, występuje cała lista przeciwwskazań do wykonywania tego typu zabiegów. Występują tutaj podstawowe przeciwwskazania, do których zaliczamy stany podgorączkowe, przeziębienia czy ostre stany zapalne, a nawet okres menstruacji u kobiet. Wszelkiego rodzaju zmiany i choroby skórne, wyprzenia, odparzenia, rany czy pęcherze. Również istnieje szereg chorób wewnętrznych, które są bezwzględnym przeciwwskazaniem do wykonywania masażu. Choroby nowotworowe, wysokie ciśnienie, wady serca, czy choroby zakaźne. Choroby wrzodowe, układu moczowego, stwierdzone tętniki, krwiaki i naczyniaki.
Należy również pamiętać, o tym, że we wczesnych stanach po złamaniach, stosowanie masaży nie jest wskazane. Również w pierwszym i ostatnim trymestrze ciąży, należy odpuścić sobie jakiekolwiek typy masażu. Należy jednak pamiętać, że w większości wypadków są to przeciwwskazania względne, które dotyczą tylko danego obrębu chorobowego, a masaż może być wykonany na innej części ciała. Istnieje również grupa schorzeń, przy których nie można stosować niektórych technik masażu, ale bez problemu można zastąpić je pozostałymi ruchami. Wszystkie dolegliwości, które budzą podejrzenie, powinny być przekazane masażyście. Dlatego też, bardzo ważne jest przeprowadzenie wnikliwego wywiadu z pacjentem, przed rozpoczęciem zabiegów.
Pozwala to na wyeliminowanie wszystkich przeciwwskazań, a także odpowiedzieć na nurtujące pytania czy niejasności.